重磅：)牛津大学的研究成果，病毒ABC，泪奔......

yanhuaandemma

剑桥大学4月9日发表了关于新冠病毒的几个变种和传播路径的研究报告发表在《美国科学院院报》（Proceedings of the National Academy of Sciences，PNAS)杂志上，题目为《Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes》，中文译名为《SARS-CoV-2基因组的进化网络分析》。

该团队基于2020年3月4日前来自于世界各地感染者的病毒基因组序列，把一种与新冠病毒的同源性高达96.2%的蝙蝠冠状病毒（即中国武汉病毒所的石正丽团队发现的BatCovRaTG13病毒），设定为新冠病毒在动物中的祖先，对“全球共享流感数据倡议组织”（GISAID）数据库中提取的、160个完整病毒基因组数据进行了基因学分析，绘制了病毒进化图谱。



专业人士+专业分析+专业传播渠道，一切都很专业。偏偏它是英文的。于是中文版本就有了做大做多的空间。



这个研究发现COVID-19存在三个主要变体，不同“变体”间紧密相关。研究人员将这三种变体标记为“A”，“B”和“C”。其中，变种“A”与蝙蝠和穿山甲中发现的病毒关系最为密切，是这次疫情暴发的根源；类型“A”经历了两次突变后产生了类型“B”；而类型“C”又来自于类型“B”。



问题到这儿就出现了。广泛传播的翻译是：A类病毒更多发现于美国和澳洲的受感染者。A类在武汉只有极少案例，且来源于在武汉生活过的美国人。A类和从蝙蝠、穿山甲身上提取的病毒最为相似。研究人员称A类病毒为“暴发根源”（“the root of the outbreak”）。B类毒株是中国境内（即武汉）主要类型，且并没有传播出东亚地区。C类病毒是欧洲主要类型。亚洲地区的香港，新加坡，韩国皆有此类型，且没有在中国大陆发现。研究人员认为，毒株C类型演化自B，B类型演化自A。



按照这个翻译，病毒来自美国和澳州就变得有科学依据了。



偏偏这个世界上能看懂英文也看得懂中文的人，并不只是一小撮。立刻就有很多人批评这个翻译偷梁换柱，断章取义。



比如，虽然类型“A”在武汉地区被发现，英文的后一句话就被翻译的人故意漏掉了：然而让人惊奇的是，这（“A”）并非武汉感染者所感染的主要病毒类型。存在于武汉地区的主要为类型“B”，该类型在整个东亚患者中普遍存在。



我找到了英文原文，发现很多有趣的地方：比如“C”型病毒变体主要存在于欧洲各国，在新加坡、中国香港和韩国病例中也有出现，但是在中国大陆样本中却没有发现该型病毒。



此外，研究人员通过对唯一一例墨西哥样本的基因组进行分析，发现该病例所携带的病毒基因组与意大利发现的病毒基因组相同。这个出现在遗传网络中的墨西哥人2月28日确诊，这一墨西哥患者在意大利感染了新冠病毒（该墨西哥患者不久前曾前往意大利旅行）。同时，根据基因组关系，意大利病毒可能源自1月27日在德国Webasto公司确诊的一名员工，而该员工可能是被一名中国同事所传染，这个中国同事的父母此前从武汉出发去看望她。此病毒的武汉—墨西哥之旅历时一个月，发生了10次突变。



剑桥大学的遗传学家彼得·福斯特（Peter Forster）博士说：“实际上发生了很多快速突变，无法完整地追踪COVID-19家族簇，我们使用了优化的网络算法来可视化所有可能的分支。”



至于为何A型病毒并没有在武汉和中国大范围地出现，而是由A型变异来的B型，彼得·福斯特博士的回应是，这可能是因为A型并不适应当地人的免疫系统，所以才变异成了B型，但也可能是因为当地更多的病例是由B型的感染者传染出去的，即遗传学上的“奠基者效应”（founder effect）。A型更多出现在美国和澳大利亚可能是因为A型更适应那里的人的免疫系统。



但这个解释目前也只是一种推测，彼得·福斯特博士也不完全肯定。剑桥大学研究团队分类命名的A、B、C三种类型的新冠病毒之间究竟存在什么样的内在关联和变异关系，或许还需要更大样本和更深入的研究结果。

keepower

难得有一篇来自主流研究机构的文章。希望以后越来越多。但是这个文章目前还没有能得出病毒起源的结论。它得出的肯定的结论是病毒目前有三个分支A，B和C。

Forster and colleagues found that the closest type of COVID-19 to the one discovered in bats – type ‘A’, the “original human virus genome” – was present in Wuhan, but surprisingly was not the city’s predominant virus type.

这段说明Type A不是武汉传播的主要类型，同时也说明武汉传播的类型超过一种。

Mutated versions of ‘A’ were seen in Americans reported to have lived in Wuhan, and a large number of A-type viruses were found in patients from the US and Australia.

这段可以得出在武汉居住的美国人身上发现变异的Type A，而且变种超过一种（versions)。然后美国和澳洲病人身上发现大量的Type A型。同时说明其他种类在澳美也存在。

说回病毒起源。那么究竟是由美国人带A到武汉，然后变异为B，最终大爆发呢。还是由在武汉感染A型的美国人把A带回美国呢？文章并没有结论。

Libra Coin

你的英文不行哦，文章说 原始的A型武汉有，但引起爆发的是B型， .  剑桥的文章狡猾狡猾的，美国和澳洲有大量的A 型， 又强调 从武汉回美国的人发现了从原始A 来的 变异A， 婉转的说明了美国A 是从武汉A变异来的，而意大利的c 直接是从B 变来的。

ZYC123

ZYC123

keepower 发表于 2020-4-12 00:09
难得有一篇来自主流研究机构的文章。希望以后越来越多。但是这个文章目前还没有能得出病毒起源的结论。它得 ...

这才是会读书的。

paulwood

英国剑桥大学及德国学者本周发表了一篇探讨新冠病毒传播溯源的研究报告，探讨新冠病毒从武汉到欧洲和北美的传播轨迹。研究发现，病毒毒株可分为A、B、C三种类型，而较为原始的版本"A型"虽然出现在武汉，但在武汉样本中更多的是变异的"B型"毒株，A型毒株在美国和澳洲研究样本上更为常见。

题为"新型冠状病毒基因组谱系分析"（Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes）的研究报告是由英国及德国学者共同撰写，于4月8日发表于美国国家科学院院刊（PNAS）。研究人员通过基因网络技术绘制出新型冠状病毒在人体的早期"进化途径"。该研究分析了从病患身上取得的前160份完整病毒基因组，得出新冠状病毒通过突变产生的不同病毒谱系。

"A、B、C"的全球分布

剑桥大学遗传学家、报告主要撰写人彼得·福斯特（Peter Forster）介绍，由于病毒发生了太多快速突变，研究人员无法完整追踪病毒的家族谱系，所以采用数学网络算法，同时找出所有可能的谱系。福斯特表示，这项技术最为人所知的用法是通过DNA追踪史前人类的动向。"我想这是首次将它用于追溯新冠病毒一类的冠状病毒感染途径。"

A型毒株在美国和澳洲研究样本上更为常见 但并不能说明病毒来源美国（资料图片）

研究团队从"全球共享流感数据倡议组织"（GISAID）的数据库中提取了2019年12月24日至2020年3月4日之间收集的160个样本，发现三种拥有密切遗传谱系的的新冠病毒类型，将其分成A、B、C三种类型。其中较为原始的毒株A型与在蝙蝠身上发现的毒株最接近。A型虽然也出现在武汉，但并非武汉最常见的毒株。

研究指出，曾经生活在武汉的美国人身上也找到此类毒株。研究发现A型更常出现在美国和澳洲感染者身上，而在武汉更常见的是从A型突变的B型毒株。总体而言，B型在东亚更为普遍，而且较少在未变异的情况下传播至其它地区。研究人员分析，原因可能是武汉出现了遗传学上的"奠基者效应"，或是东亚以外的人群更能"抵抗"这一型的毒株。

由B型变异而来的C型主要出现在欧洲，在早期的法国、意大利、瑞典和英国患者身上能找到。虽然在研究中的中国患者样本上没有出现C型，但见于新加坡、香港和韩国。

基本上，在疫情暴发的第一阶段，欧洲、美国和澳洲等东亚以外地区最常见的是A型和C型。B型则是在东亚最为常见。C型早期时出现在新加坡，这也是欧洲第一批感染者身上常见的毒株类型。

无法判定病毒起源

这一研究报告在中国社交媒体上引起广泛讨论，认为这份报告可以成为新冠肺炎不是起源于武汉的佐证。报告主笔之一Peter Forster在接受《环球时报》采访时表示，鉴于中美之间的政治纠纷，他明白病毒起源的议题是"烫手山芋"，但这份报告以及他们目前正在进行的研究并不能给出明确解释。

至于为何A型病毒没有在武汉大范围感染，福斯特分析可能是"A型无法适应当地人的免疫系统"因此变异成B型，另一方面A型病株则适应了美国和澳洲人的免疫系统。

该研究团队目前正将其研究样本扩大至1001个病毒基因组。虽然研究结果尚未出炉，但福斯特表示，第一批感染以及病毒传播发生在去年9月中旬至12月初之间。

研究人员认为，采用基因网络技术的分析方式将有助于预测下一个疫情暴发的地点。以意大利为例，意大利的"一号病人"起初被认为是曾与前往武汉的熟人接触而感染，但后者身上并未验出病毒，寻找"零号病人"的过程最终陷入死胡同。福斯特的研究则发现，意大利最早的感染案例或可追溯至1月27日被通报感染的一名德国患者，另一名初期的意大利感染病例则与"新加坡感染群"有关。

larryshui

这个研究使用的基因样本很少只有一百多个。现在已经有六七千个病毒样本了。中国武汉的病毒样本公开上传的也不多。没有代表性。https://www.gisaid.org/epiflu-applications/next-hcov-19-app/

直面异议

yanhuaandemma 发表于 2020-4-11 23:53
剑桥大学4月9日发表了关于新冠病毒的几个变种和传播路径的研究报告发表在《美国科学院院报》（Proceedings  ...

又来秀下限，人家引用的就是英文媒体！

而且环球时报特别采访过作者，作者也解释过。没人误解过，就你这种自嗨的才会吧！

我觉得，论坛里的有些人，别觉得只有自己“懂”英文，你们有些就真得只是货！

keepower

太阳鸟鸟 发表于 2020-4-12 01:04
重点是现在不能就叫嚣病毒起源于中国并要纠集全世界无耻地天价索赔以转移美国英国自己消极抗疫的失误。 ...

从科学角度说，现在可知的确凿证据都是指向武汉，除非像类似此类的研究可以证明起源并非武汉。现在西方宣传攻击的主要方向是老共初期的掩盖和对WHO的误导，现在频频把台湾和WHO拉上来也是为了证明这。这点老共是很难很难洗清的。这个事情责任很大的，他们自己知道，也很害怕的，不然不会找个外交部发言人在Twitter上说是美军带进来的。

keepower

太阳鸟鸟 发表于 2020-4-12 01:32
这个我是框出来了的，在武汉居住的美国人身上发现A,为什么不能是从美国带到武汉的呢？毕竟美国二月都在消 ...

有可能。但是剑桥的研究无法证明。

masterq

masterq

升工資了~~

雪2003

masterq 发表于 2020-4-12 12:48

呵呵 方舟子

雪2003

masterq 发表于 2020-4-12 12:48

呵呵 方舟子

masterq

雪2003 发表于 2020-4-12 12:57
呵呵 方舟子

為什么要發二次?哈哈~~

masterq

雪2003 发表于 2020-4-12 12:55
呵呵 方舟子

恆大粉絲?

3691011

新马甸甸 发表于 2020-4-11 21:17
病毒来自于哪里并无所谓，即便真的起源于中国也不可怕，中国政府对病毒爆发一开始就是公开透明的。

可怕 ...

批艾芬，李文亮，为什么不让他她们说话？明明传染了几十人说不传染是公开透明的？？ 为什么几十亿疫情警报系统失灵？呵呵！

小呢呢

keepower 发表于 2020-4-12 12:45
从科学角度说，现在可知的确凿证据都是指向武汉，除非像类似此类的研究可以证明起源并非武汉。现在西方宣 ...

特朗普想用台湾来甩锅？不可能！台湾获得的咨询不可能都是自己凭空想象的（无非通过大陆和香港），而且美国的所有情报部门在香港早就得知11月底武汉有不明肺部传染疾病了，反对川普的媒体早就得知，川普砍了cdc的10%预算，撤走了北京的全部传染病专家组，韩国和美国的一号病例出现在同一天，韩国立刻采取了行动。白宫在1月底有被纳瓦罗最高级别警告过，川普已经不可能甩锅了，现在连比尔盖茨都被川粉怀疑是总策划人！

大陆医院上报的第一个病例在12月中旬，而且有通报WHO，12月底的李闻亮和国家正式通报WHO所有的细菌结构和感染情况和数量都在同一周内，之差三四天都在12月底。唯一重大错误是人不传人，这个可以是科研工作的失误导致。至于11月中旬的首个病例，这是通过12月下旬确诊病例报告后，对新病毒有了了解才回溯历史摸索回去的。因为这个病菌和流感一摸一样，起初11月被误症是再正常不过的事情了。

中国只要把这些主要的时间线索告知西方大众，正常人自己想一想，美国今天的局面，中国不需要负责。 难不成今后美国的情报部门要在中南海设个联络专员的办公室不成？

小呢呢

3691011 发表于 2020-4-12 13:39
批艾芬，李文亮，为什么不让他她们说话？明明传染了几十人说不传染是公开透明的？？ 为什么几十亿疫情警报 ...

李闻亮12月30 吹哨，1月第一周who已经得到了大陆的所以情况，1月23日武汉封城，那个爱芬啥时候制作了勺子？

3691011

小呢呢 发表于 2020-4-12 14:21
李闻亮12月30 吹哨，1月第一周who已经得到了大陆的所以情况，1月23日武汉封城，那个爱芬啥时候制作了勺子 ...

艾芬是前天报料。奇怪了，当时被训诫的李文亮现在又被当局封为英雄，弄巧了？还是弄绌了？好像国际上有人回应外交部说中国有言论自由提出要见吹哨 人和公民记者。

小呢呢

3691011 发表于 2020-4-12 15:38
奇怪了，当时被训诫的李文亮现在又被当局封为英雄，弄巧了？还是弄绌了？ ...

哦 看错了！ 不好意思！

3691011

小呢呢 发表于 2020-4-12 15:43
这叫发夹弯，全世界政府可以做，中国为啥不能做？自己错误自己改不可以吗？李文亮当时是书面警告，当天就 ...

喂，你看得懂中文吗？有理解能力吗？我帖是回应人家说的‘中国始终透明处理疫情’！你啰啰嗦嗦讲腐朽没落的美国干嘛？你愿拿自己的长相与凤姐比吗？ 呵呵。

小呢呢

3691011 发表于 2020-4-12 15:54
喂，你看得懂中文吗？有理解能力吗？我帖是回应人家说的‘中国始终透明处理疫情’！你啰啰嗦嗦讲腐朽没落 ...

看错了 不好意思！

3691011

小呢呢 发表于 2020-4-12 15:58
看错了 不好意思！

Sorry，我言重了。握手。

小呢呢

3691011 发表于 2020-4-12 15:59
Sorry，我言重了。握手。

追认他是英雄，他确实是被冤枉，虽然是一张保证书，要命的是他后来感染死了，这个就是叠加效应，2者加载一起，谁看了都受不了，何况他自己也是个好党员在当时的社会环境下！ 政府无论是对党内同志和社会百姓都必须及时处理。

包不同

这个台湾的节目的一个专家也说了， 但说完后再也没看见他上过节目了

不明白楼主泪奔个啥？

首先，这是剑桥大学的研究，被楼主说成是牛津大学。这是得激动成啥样？

其次，剑桥大学这篇研究里的所有证据指向新冠病毒发源于武汉。

其三，这篇研究表明目前尚无证据支持所谓的美国起源说。

楼主该去语言学校重读英文了。